Una serie di problemi strutturali mise più volte il campanile in pericolo.
All'inizio del XX secolo, una ispezione approfondita evidenziò numerose crepe che portarono alla demolizione del campanile romanico nel 1904.
Il campanile della basilica di San Siro si presentava con la tipica struttura romanica che ancora oggi si può osservare dalle Vigne, dalla Commenda di Pre e da Sant'Agostino.