Il progetto è stato ideato dall'artista Lucy Orta insieme agli studenti e studentesse dei due licei del quartiere: lo scientifico Ettore Majorana e l'artistico Renato Cottini. L' opera nasce per rispondere alla richiesta dei due gruppi della necessità di avere, nel nuovo parco, un luogo aperto dove incontrarsi. Da qui il nome atoll, cioè un atollo, una specie di porto franco.