Il nucleo primitivo, di origine romana, era probabilmente situato sulle colline nella frazione di Santa Maria delle Grazie. Da documenti del XII sappiamo che a quel tempo c'era un castello eretto per difendere il borgo di Macugnano: I feudatari del Canavese si divisero il territorio e il paese toccava ai San Martino di Rivarolo e di Agliè. Il paese subiva le conseguenze delle lotte fra i guelfi San Martino d'Agliè e i ghibellini, conti di Valperga: razzie, incendi e devastazioni si susseguirono per anni. L'imperatore Carlo V, nel 1355, donò ai marchesi di Monferrato molte terre fra cui Agliè, ma nel 1391 arrivò, grazie ai Savoia, la pace.