Uno dei più grandi organi del Veneto, realizzato dai Fratelli Ruffatti e da Ongaro ai primi del 1900. Dispone di quattro tastiere ed è diviso in due: il corpo principale sulla cantoria in controfacciata, il minore nella cupola che sovrasta l'abside, in modo da assicurare un suono avvolgente per chi ascolta nell'aula ellittica.